氏名 : 佐久間 基樹 (281067171)
所属 : 美宅研
題目 : 一本型膜蛋白質型レセプター予測システムの開発及びそれを用いたゲノム解析
概要 :
膜蛋白質は蛋白質の約4分の1を占めており、その中でも一本型膜蛋白質が膜蛋
白質中の半分を占めている。その一本型膜蛋白質はシグナル伝達や 免疫機能の
ような重要な機能を担っている。
本研究では、一本型膜タンパク質予測システムSOSUImp1を用いて、原核生物と真
核生物のゲノム データに対し、一本型膜蛋白質の予測を行った。その結果をも
とに一本型膜蛋白質の代表的な機能で且つ多細胞生物の本質的な機能であるレセ
プター(受容体)に着目して解析を行った。一本型膜蛋白質の膜貫通領域よりN
端側とC端側のドメインの2つの領域を考え、長さで分布を調 べた結果、レセプ
ターとレセプターでないもので異なる分布を示した。レセプターのものはいくつ
かの密集する領域が見られたので、エリアに 分けながら各エリアにおいて物理
学的性質から正準判別分析を用いて識別スコアを計算することにより、高い精度
でレセプターであるかレセプ ターでないかを予測することができた。
その予測システムを29種類の真核生物のゲノムに対して一本型膜蛋白質のレセプ
ター予測を行った結 果、植物や動物によっても異なる結果が得られた。
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